Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD1Q99460 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms