Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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