Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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