Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms