Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ACTBP60709 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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