Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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