Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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