Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD3A2A2Y4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms