Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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