Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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