Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SGCZQ96LD1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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