Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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