Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG9BQ674R7 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms