Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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