Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms