Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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