Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms