Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms