Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms