Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC239859.5-201ENST00000614100 1232 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 IQCD-201ENST00000299732 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 IFT43-202ENST00000314067 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC009237.11-201ENST00000425635 265 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC011890.1-201ENST00000427955 303 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RAD52-212ENST00000541619 560 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC134312.5-202ENST00000562705 756 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AL356414.1-201ENST00000379526 686 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RPL10P12-201ENST00000427342 318 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MIR2110-201ENST00000459421 75 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC113346.2-201ENST00000502684 457 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RHOJ-202ENST00000555125 548 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC103740.2-201ENST00000557900 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AL136084.3-201ENST00000605631 439 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SPDL1-216ENST00000629457 340 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AL669831.6-201ENST00000635557 837 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 DHRS1-202ENST00000396813 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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