Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ODF3BA8MYP8 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms