Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC073316.2-201ENST00000414126 418 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP34Q70CQ2 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms