Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF827Q17R98 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms