Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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