Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRJQ12913 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRJQ12913 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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