Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ASIC1P78348 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ASIC1P78348 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ASIC1P78348 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ASIC1P78348 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ASIC1P78348 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ASIC1P78348 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ASIC1P78348 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ASIC1P78348 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ASIC1P78348 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIC1P78348 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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