Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SH3BP2P78314 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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SH3BP2P78314 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SH3BP2P78314 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SH3BP2P78314 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SH3BP2P78314 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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