Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms