Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms