Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFNP31947 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFNP31947 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms