Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PTPRT-212ENST00000620410 940 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SUCLG2P2-201ENST00000307241 1296 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TMEM176A-201ENST00000004103 1261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC246680.1-201ENST00000444624 494 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FAM95B1-214ENST00000593216 759 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AL513478.3-201ENST00000641038 1095 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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PTPRMP28827 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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PTPRMP28827 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC103925.1-201ENST00000453155 771 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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PTPRMP28827 AP005203.1-202ENST00000584204 561 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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PTPRMP28827 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CHIA-207ENST00000451398 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RN7SL833P-201ENST00000498758 284 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MPHOSPH6-203ENST00000563504 617 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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