Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP4AP20648 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms