Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRHP20396 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRHP20396 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRHP20396 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRHP20396 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRHP20396 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRHP20396 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRHP20396 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRHP20396 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 RN7SL313P-201ENST00000497618 288 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC008870.3-201ENST00000566143 641 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC006111.1-201ENST00000573982 329 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 RN7SL784P-201ENST00000577319 342 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRHP20396 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 USP4-204ENST00000416417 1536 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 OR1X5P-201ENST00000510464 894 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC104371.1-201ENST00000522077 797 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 IGHV1OR16-2-201ENST00000564937 349 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 CNN2P9-201ENST00000417134 909 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 RN7SL614P-201ENST00000461850 280 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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