Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms