Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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