Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms