Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A4GALTQ9NPC4 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms