Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms