Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TLR1Q15399 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms