Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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