Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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