Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MASP1-201ENST00000169293 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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