Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMTNP53814 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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