Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACADSBP45954 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms