Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TGFBR1P36897 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms