Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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