Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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