Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT1P21579 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT1P21579 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms