Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms