Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms